黑水县位于四川阿坝州中部,平均海拔3544米,县城海拔2350米。黑水境内群山屹立,山峦起伏,群峰对峙,河谷深切,海拔5200米以上雪峰4座。境内岷江上游三条支流黑水河、毛儿盖河、小黑水河和48条溪流形成网系。
黑水县以境内黑水河而得名。藏语安多方言称黑水为“措曲”,“措”生铁之意、“曲”水这意,引伸为黑水。因河流贯穿全境,河水呈黑色故称。1952年7月24日,黑水获得解放,同年9月成立黑水行政委员会(县级)。1953年12月建置芦花县,1954年更名为黑水县。
黑水县气候属季风高原型气候区,旱、雨季分明,日照充足,年温差较小,日温差大。气温随海拔不同高度差异很大,降雨分布不匀,夏季集中,秋季阴雨连绵。
黑水县境内有丰富的自然资源,是四川重要的锰矿资源基地。黑水县有锰、铁、钨、石灰石、硫磺等矿藏。锰矿储量较大,含磷低,具有工业开采价值。黑水县境内河流纵横,水量充沛,河床陡,水流急,落差大,水力资源十分丰富。全县水能理论蕴藏量170万千瓦,可开发量120万千瓦。原始森林覆盖在336万亩林地上,是岷江、长江的天然绿色屏障,黑水县境内盛产虫草、贝母、天麻、羌活、大黄、木香、黄芪等名贵中药材,还有蕨菜、野生角羚、金丝猴、二级保护动物猕猴、黑熊、盘羊、藏马鸡等。独特的气候优势使这里还成为建立水果、干果和反季节无污染蔬菜、发展生态农业的重要基地。